¿Cómo puede ser Juan el Bautista el hombre más grande nacido de mujer, cuando Jesús también nació de mujer?

Me gusta mucho la respuesta de enegue.

Sólo añadiría que la distinción que hace Jesús

11 En verdad os digo entre los nacidos de mujer no se ha levantado nadie más grande que Juan el Bautista. Sin embargo, el más pequeño en el reino de los cielos es mayor que él. 12 Desde los días de Juan el Bautista hasta ahora el reino de los cielos ha sufrido violencia,[d] y los violentos lo toman por la fuerza. 13 Porque todos los Profetas y la Ley profetizaron hasta Juan, 14 y si estáis dispuestos a aceptarlo, él es Elías que ha de venir. (Mateo 11 RVR)

es entre los nacidos de la carne y los nacidos del Espíritu.

Como en la conversación de Jesús con Nicodemo existe una distinción entre los de nacimiento puramente natural y los que han nacido de lo alto. Jesús, aunque primogénito de entre los muertos y preeminente en todas las cosas, estaba, en ese momento, ocupando el lugar más bajo en la carne, el último que será el primero. Él es el más grande en el Reino de los Cielos y, por lo tanto, (como todos los que nacen de nuevo por la fe en él) está excluido de la categoría de «los nacidos de mujer».

En la introducción de su carta a los Romanos, Pablo dice esto

³En cuanto a su Hijo Jesucristo, nuestro Señor que fue hecho de la semilla de David según la carne;
— Romanos 1:3 (RV)

El griego aquí es: τοῦ ^{el que} γενομένου ^{al ser hecho} ἐκ ^de σπέρματος ^{de la semilla} Δαυὶδ ^{de David}

También, en su carta a la iglesia de Galacia, Pablo dice esto:

⁴Pero cuando llegó la plenitud del tiempo, Dios envió a su Hijo hecho de mujerhecho bajo la ley,
— Gálatas 4:4

De nuevo, el griego aquí es: γενόμενον ^{al ser hecha} ἐκ ^de γυναικός ^{de la mujer}

El pasaje citado por el OP contiene esto:

¹¹En verdad os digo, Entre los nacidos de mujer no se ha levantado uno mayor que Juan el Bautista; sin embargo, el más pequeño en el reino de los cielos es mayor que él.
— Mateo 11:11 (RV)

El griego aquí es: ἐν ^entre γεννητοῖς ^{los nacidos} γυναικῶν ^{de las mujeres}

Así, Jesús dice que Juan era γεννητοῖς ^nacido de una mujer, pero Pablo dice que Jesús fue γενόμενον ^{hecho de} una mujer. ¿Cuál es la diferencia?

Claramente, ser «nacido de mujer» se refiere a la concepción mediante la unión sexual humana, es decir, el proceso que da lugar a la fecundación de un óvulo por un espermatozoide. Sin embargo, Jesús no nació de esta manera:

³⁵El ángel respondió y le dijo: El Espíritu Santo vendrá sobre ti, y el poder del Altísimo te cubrirá con su sombra; por eso también el santo que nacerá de ti será llamado Hijo de Dios.
— Lucas 1:35 (KJV)

Aparte de los que creen que los seres no corpóreos tienen trozos reproductivos con los que pueden aparearse con seres corpóreos, entonces esto representa lo que Pablo se refirió como ser «hecho de mujer», es decir, estar unido en el vientre de una mujer.

Para aquellos que se inclinan a imaginar la unión sexual aquí, Pablo refuta fuertemente tal noción cuando escribe que Jesús fue «hecho bajo la ley» (Gálatas 4:4, arriba), pues cuando José estaba contemplando «repudiar» (divorciarse) a su prometida, el Ángel le dijo

²⁰… José, hijo de David, no temas recibir a María, tu mujer, porque lo que en ella se concibe es del Espíritu Santo.
— Mateo 1:20 (RV)

Habría sido una violación de la ley que María hubiera sido tomada «sexualmente» y luego entregada a otro sin un certificado de divorcio. Contrarrestar la noción de «unión sexual» era claramente lo que Pablo tenía en mente cuando escribió que Jesús fue «hecho bajo la ley», de lo contrario no se habría referido a ello.

Juan registra las palabras de Jesús:

⁶³El espíritu es el que da vida; la carne no aprovecha nada; las palabras que yo os digo son espíritu y son vida.
— Juan 6:63 (KJV)

El espíritu es lo que mueve un cuerpo y le da vida. Aquellos «nacidos de mujer» tienen un espíritu que está separado de Dios. El Espíritu de Dios puede coexistir con el espíritu del hombre para tratar de moverlo en contra de sus inclinaciones carnales, pero no extinguirá la libertad de su espíritu para hacerlo. Registros de Lucas:

¹⁵Porque será grande a los ojos del Señor, y no beberá ni vino ni sidra; y estará lleno del Espíritu Santo, incluso desde el vientre de su madre.
— Lucas 1:15 (KJV)

Así pues, el Espíritu Santo coexistió con el espíritu de Juan desde el momento en que entró en el mundo.

Sin embargo, la forma del nacimiento de Jesús tuvo que ser tal que sólo el Espíritu de Dios fue el poder que lo movió. El saco de huesos (que no aprovecha nada) que llevaba el nombre de Jesús, tuvo un principio, pero el Espíritu que movía el saco de huesos era el Espíritu eterno de Dios solamente. Jesús fue libre de expresar la agonía y la angustia de su carne a través de las pruebas terrenales, pero fue Dios mismo quien experimentó la angustia y la agonía y el rechazo, no el espíritu de un hombre con el que convivía el Espíritu Santo.

Conclusión

Cuando Jesús dijo: «entre los nacidos de mujer no se ha levantado nadie más grande que Juan el Bautista«, era plenamente consciente de la naturaleza milagrosa de su propio nacimiento. Jesús no nació de una unión sexual, sino de «el poder de lo alto«que lo unió literalmente en el vientre de su madre, un gameto sagrado formado por los atributos genéticos de José y María.

Sólo al final de la línea de tiempo podemos comprender plenamente lo que Dios ha hecho.

¿Cómo puede ser Juan el Bautista el mayor hombre nacido de mujer, cuando Jesús también nació de mujer?

11 En verdad os digo que entre los nacidos de mujer no se ha levantado nadie más grande que Juan el Bautista. Sin embargo, el más pequeño en el reino de los cielos es más grande que él. 12 Desde los días de Juan el Bautista hasta ahora el reino de los cielos ha sufrido violencia,[d] y los violentos lo toman por la fuerza. 13 Porque todos los Profetas y la Ley profetizaron hasta Juan, 14 y si estáis dispuestos a aceptarlo, él es Elías que ha de venir. (Mateo 11 RVR)

En primer lugar, parece lógico que Nuestro Señor no estaba hablando de sí mismo. Es cierto que Nuestro Señor también nació de una mujer. Pero Jesús fue igualmente concebido por el poder del Espíritu Santo y por lo tanto no fue concebido de la misma manera que el resto de la humanidad.

Viendo que has citado al Papa Francisco, creo que es bueno dar una perspectiva más católica a tu pregunta.

Parece que no hay declaraciones oficiales sobre el tema de Mateo 11:11, al menos no al nivel de implicar la infalibilidad papal. Sin embargo, hay algunos escritores católicos y Doctores de la Iglesia que han escrito sobre el tema de San Juan el Bautista como el más grande nacido de mujer, y que sin embargo es el más pequeño en el reino de los cielos.

Vemos en los Salmos que el hombre fue hecho poco menos que los ángeles (Salmo 8:4-6).

Santo Tomás de Aquino cita varias veces el pasaje de Mateo 11:11 en su Suma Teológica para diversas cuestiones. También debemos tener en cuenta que en el momento en que Nuestro Señor pronunció estas palabras sobre San Juan, la humanidad aún no había sido admitida en el reino de los cielos porque el sacrificio de Jesús en la Cruz aún no había ocurrido.

Ahora Santo Tomás nos dice en una de sus preguntas (¿Si hay varios órdenes en una misma jerarquía?): «El ángel inferior es superior al hombre más alto de nuestra jerarquía, según las palabras: «El que es el menor en el reino de los cielos, es mayor que él», es decir, Juan el Bautista, que «no se ha levantado uno mayor entre los nacidos de mujer» (Mat. 11:11). Por lo tanto, el ángel menor de la jerarquía celestial no sólo puede limpiar, sino también iluminar y perfeccionar, y de manera más elevada que las órdenes de nuestra jerarquía. Así pues, las órdenes celestiales no se distinguen en razón de éstas, sino en razón de otros actos diferentes».

Así se puede concluir que Nuestro Señor hablaba de San Juan en comparación con los ángeles que están en el cielo.

En otra cuestión (si Moisés fue el más grande de los Profetas), Santo Tomás afirmó: «Además, está escrito (Mateo 11:11) que «no se ha levantado, entre los nacidos de mujer, uno mayor que Juan el Bautista». Por lo tanto, Moisés no fue más grande que todos los profetas».

Como católicos creemos que, por una prerrogativa divina de Dios, María fue concebida sin mancha de pecado original. No es imposible que San Juan, aunque no haya sido concebido inmaculadamente, haya sido purificado cuando aún estaba en el vientre de Santa Isabel. Aunque no es un dogma, la Iglesia aún no se ha pronunciado sobre este tema.

«Hay una sólida tradición en la Iglesia que dice que San Juan Bautista fue purificado del pecado original poco después de ser concebido, cuando aún estaba en el vientre de Santa Isabel. Por lo tanto, este episodio del Evangelio que se refiere a que el niño en el vientre materno escuchó la voz de la Virgen, entendió sus palabras y la amó es completamente creíble.» – Profesor Plino Correa de Olivra

He aquí cómo Wikipedia lo pone:

«Algunos católicos han mantenido la creencia de que Juan el Bautista nunca pecó, aunque esto nunca ha sido un punto de doctrina y no es vinculante en la creencia para ningún adherente como lo es la impecabilidad de María. En su Tratado de la Oración, Santa Catalina de Siena incluye un breve altercado con el Diablo en relación con su lucha debido a que el Diablo intenta atraerla con vanidad y adulación. Hablando en primera persona, Santa Catalina de Siena responde al Diablo con las siguientes palabras

…humillación de ti misma, y respondiste al Diablo con estas palabras: ‘¡Desgraciada que soy! Juan el Bautista nunca pecó y fue santificado en el vientre de su madre. Y yo he cometido tantos pecados…» – Catalina de Siena, Tratado de la oración, 1370[85][86]» Santa Catalina de Siena fue declarada Doctora de la Iglesia el 3 de octubre de 1970 por el Papa Pablo VI.

La Enciclopedia Católica dice lo siguiente

«Durante el sexto mes había tenido lugar la Anunciación y, como María había oído del ángel el hecho de que su prima había concebido, fue «con premura» a felicitarla. «Cuando Isabel oyó la salutación de María, el niño» -lleno, como la madre, del Espíritu Santo- «saltó de alegría en su seno», como si reconociera la presencia de su Señor. Entonces se cumplió la profecía del ángel de que el niño «estaría lleno del Espíritu Santo desde el vientre de su madre». Ahora bien, como la presencia de cualquier pecado es incompatible con la morada del Espíritu Santo en el alma, se deduce que en ese momento Juan quedó limpio de la mancha del pecado original. Cuando «llegó el momento de dar a luz a Isabel. .dio a luz un hijo» (1:57); y «al octavo día vinieron a circuncidar al niño, y le pusieron el nombre de su padre, Zacarías. Y su madre, respondiendo, dijo No, sino que se llamará Juan. Y le dijeron: No hay ninguno de tu familia que se llame así. Y le hicieron señas a su padre de cómo quería que se llamara. Y exigiendo una tabla de escribir, escribió, diciendo: Juan es su nombre. Y todos se extrañaron» (1:59-63). No sabían que no podía aplicarse un nombre mejor (Juan, en hebreo; Jehohanan, es decir, «Jahweh tiene misericordia») a quien, como profetizó su padre, iba a «ir delante de la faz del Señor para preparar sus caminos; para dar conocimiento de la salvación a su pueblo, para la remisión de sus pecados: por las entrañas de la misericordia de nuestro Dios» (1:76-78). Por otra parte, todos estos acontecimientos, a saber, el nacimiento de un niño de una pareja anciana, la súbita mudez de Zacarías, su igualmente súbita recuperación del habla, su asombrosa expresión, podrían justamente golpear con asombro a los vecinos reunidos; éstos no podían dejar de preguntar: «¿Qué será, pensáis, este niño?» (1:66).» – Nuevo Adviento.

Ahora bien, si San Juan fue de hecho purificado mientras estaba en el vientre de su madre, sería el más grande de los nacidos de mujer. La concepción inmaculada de María la sitúa por encima de San Juan a los ojos de la Iglesia, por un privilegio divino único concedido a la Madre de Jesús. Sin embargo, esto es una cuestión aparte.

Juan el Bautista fue «Hombre nacido de mujer».
Jesús, el Hijo de Dios, fue «Dios nacido de mujer».

Jesús era el Hijo de Dios, la Palabra Viva de Dios nacida o entregada por una mujer. El capítulo 1 del Evangelio de Juan nos dice que

En el principio era la palabra y la palabra estaba con Dios y la palabra era Dios…… Jesús «vino» a los suyos, pero los suyos no lo recibieron.